El Consejo de Estudiantes es el órgano colegiado, representado por los estudiantes para proteger y promover los derechos y deberes académicos y de convivencia y para asegurar y garantizar el continuo ejercicio de la participación por parte de los educandos en el desarrollo de las actividades propias del Seminario.

El Consejo Estudiantil estará conformado por un alumno vocero de cada uno de los grados que ofrece la institución. Los alumnos del nivel preescolar y de los tres primeros grados del ciclo de primaria, serán convocados a una asamblea conjunta para elegir un vocero único entre los alumnos que cursan el tercer grado.

Una vez conformado el consejo tendrá una propia organización distribuida en la siguiente manera: Presidente, Vicepresidente, Secretario y Vocales.