El color azul significa nobleza y caballerosidad, disciplina y serenidad, y la estrella de oro de cinco puntas  representa a la Virgen María ejemplo de obediencia y patrona del Seminario. También la estrella es el ideal del seminarista, llamado a la excelencia, para servir mejor.

El verde es símbolo de esperanza y la cruz de oro es símbolo de vida perenne es la conjugación de la obediencia y del amor, virtudes que dieron la victoria a Cristo y con las cuales conseguirá el sacerdote y el líder católico la construcción del Reino de Dios y la Salvación del mundo.

El rojo significa el amor y el águila explayada es símbolo de San Juan Evangelista, patrono del Seminario, que resalta como ejemplo de amor y virtudes.

El lema del escudo: “Confiemos en la victoria de la Cruz”; porque sólo en la Cruz se salvará el hombre; sólo en la Cruz aprenderá a vivir; sólo en la Cruz conseguirá el amor que debe impulsar todo acto humano como impulsa las obras de Dios.

HIMNO

Letra: Pbro. José Claros Villaní
Música: Maestro Leonardo Pasos

CORO
Jubilosos un himno entonemos
anhelantes de célica luz,
donde a Dios y su voz escuchemos
invitados por Cristo enla Cruz.
Del Sagrario la fuente buscamos
para el alma su sed mitigar
y venero fecundo encontramos
y se ve la virtud germinar.
I
Por tus huellas divinas, Señor,
rutilantes de paz y dulzura
van tus huestes sembrando el amor,
ese amor que en tu pecho fulgura.
Militantes inermes de Cristo
nuestra lucha será por el bien.
Ya el prodigio que siglos han visto
es pregón de victoria en Belén
II
Hacia el puerto soñado avancemos
por la ruta de lento bajel,
y en el faro divino confiemos
porque todos se orientan por Él.Cuida siempre la planta lozana
donde el surco se ve florecer,
allí dora la espiga temprana y
los frutos que vas a ofrecer.
III
Como antorcha de lumbre divina,
fulgurante y vivaz en la altura,
nuestra vida también ilumina
Esta senda radiante de albuna.
Esa gracia que cifra un arcano
nuestros pasos dirige al altar
y el milagro que adora el cristiano
de las almas será su manjar.